Perfil transcriptómico y análisis exploratorio funcional del efecto de los polifenoles de romero (Rosmarinus officinalis) en la expresión génica de las células SW480 de cáncer de colon humanas

Abstract

En este trabajo se ha empleado un enfoque foodómico al estudio del efecto de un extracto fenólico de romero (Rosmarinus officinalis) en la expresión génica de la línea celular SW480 de cáncer de colon. Para ello, se ha utilizado el microarray de alta densidad de oligonucleótidos Human Gene 1.0ST (Affymetrix), se han procesado los datos y se han empleado distintos criterios de filtrado para efectuar la identificación de aquellos genes expresados diferencialmente con el tratamiento con polifenoles. Se estudió la influencia del filtrado tanto en el número de genes identificados, como en el número de falsos positivos estimados. Además, como se observó en los resultados del análisis de enriquecimiento funcional, la sobre-representación (enriquecimiento) de algunas anotaciones funcionales como, p.e., “muerte celular” y “regulación de la apoptosis” varía en función el criterio empleado para identificar los genes expresados diferencialmente.