Cancer informative biomarker signature

Abstract

[EN] The present invention provides a method for deciding a check-point inhibitor (ICI)-based therapy, for a patient suffering from cancer, the method comprising the steps: a) measuring the expression level of the following markers: TGFB1, ZEB1, FAP, ZEB2, GLUL, ENTPD1, GOT1, LDHA, TWIST1, and GLS, in an isolated cancerous biological tissue sample from the patient; b) determining which markers are differentially expressed; and c) classifying the sample, depending on the markers differentially expressed, in one of the following clusters: cluster 1: when ZEB1, ZEB2, ENTPD1, FAP and GLUL are up-regulated; cluster 2: when GLS is upregulated; and LDHA, GOT1, ZEB1, ZEB2 and ENTPD1 are downregulated; and cluster 3: when GOT1 is upregulated and TGFB1 and TWIST 1 are downregulated.

[FR] La présente invention concerne un procédé permettant de décider d'une thérapie à base d'inhibiteurs de points de contrôle (ICI), pour un patient souffrant d'un cancer, le procédé comprenant les étapes suivantes : a) mesure du niveau d'expression des marqueurs suivants : TGFB1, ZEB1, FAP, ZEB2, GLUL, ENTPD1, GOT1, LDHA, TWIST1 et GLS, dans un échantillon de tissu biologique cancéreux isolé provenant du patient ; b) détermination des marqueurs exprimés de manière différentielle ; et c) classification de l'échantillon, en fonction des marqueurs exprimés de manière différentielle, dans l'un des groupes suivants : groupe 1 : lorsque ZEB1, ZEB2, ENTPD1, FAP et GLUL sont fortement exprimées ; groupe 2 : lorsque GLS est fortement exprimée ; et LDHA, GOT1, ZEB1, ZEB2 et ENTPD1 sont faiblement exprimées ; et groupe 3 : lorsque GOT1 est fortement exprimée et TGFB1 et TWIST 1 sont faiblement exprimées.