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Gómez-Skarmeta, José Luis

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Perfil

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Firma en Digital.CSIC (*)
Gómez-Skarmeta, José Luis
 
Centro o Instituto
CSIC-JA-UPO - Centro Andaluz de Biología del Desarrollo (CABD)
 
Departamento
Regulación génica y morfogénesis. Grupo: Estudios de genómica funcional para comprender el desarrollo, la evolución y las enfermedades genéticas humanas
 
Categoría Profesional
Principal Investigator (In memoriam 2020)
 
Especialización
Ensayos de epigenómica, experimentos de captura cromosómica, análisis de actividad cis-reguladora mediante transgénesis y estudios mutagénicos para determinar como los elementos cis-reguladores y la estructura de la cromatina contribuyen al desarrollo y a la evolución, y como alteraciones en esta parte no-codificante del genoma afecta a la salud humana.
 
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DerechosPreviewFecha Public.TítuloAutor(es)Tipo
1openAccess4Cin_Irastorza_Art_PV.pdf.jpg3-sep-20184Cin: A computational pipeline for 3D genome modeling and virtual Hi-C analyses from 4C dataIrastorza-Azcárate, Ibai CSIC ORCID; Acemel, Rafael D. CSIC ORCID; Tena, Juan J. CSIC ORCID; Maeso, Ignacio CSIC ORCID; Gómez-Skarmeta, José Luis CSIC ORCID ; Devos, Damien P. CSIC ORCIDartículo
2openAccessCommon_Royo_Art_PV.pdf.jpg8-mar-2018A common copy-number variant within SIRPB1 correlates with human out-of-Africa migration after genetic drift correctionRoyo, José Luis CSIC ORCID; Valls, Joan; Acemel, Rafael D. CSIC ORCID; Gómez-Marín, Carlos CSIC ORCID; Pascual-Pons, Mariona; Lupiañez, Arantxa; Gómez-Skarmeta, José Luis CSIC ORCID ; Fibla, Joanartículo
3openAccessIroquois_genes_2008.pdf.jpg20-ago-2008A dual requirement for Iroquois genes during Xenopus kidney developmentAlarcón, Pilar CSIC; Rodríguez-Seguel, Elisa CSIC; Fernández-González, Ana CSIC; Rubio, Ruth; Gómez-Skarmeta, José Luis CSIC ORCID artículo
4openAccessmobile insulator.pdf.jpg2014A mobile insulator system to detect and disrupt cis-regulatory landscapes in vertebratesBessa, José CSIC ORCID; Luengo, Mario CSIC; Rivero-Gil, Solangel CSIC; Ariza-Cosano, Ana CSIC; Ruiz-Ruano, Francisco J. CSIC ORCID; Naranjo, Silvia CSIC ORCID; Carvajal, Jaime J. CSIC ORCID; Gómez-Skarmeta, José Luis CSIC ORCID artículo
5openAccesspolymorphic_enhancer_Lewis.pdf.jpg21-ago-2014A polymorphic enhancer near GREM1 influences bowel cancer risk through differential CDX2 and TCF7L2 bindingCalle-Mustienes, Elisa de la CSIC ORCID; Giráldez-Pérez, Rosa María; Carvajal, Jaime J. CSIC ORCID; Gómez-Skarmeta, José Luis CSIC ORCID ; Tomlinson, Ianartículo
6openAccessA role for insulator.pdf.jpg2012A role for insulator elements in the regulation of gene expression response to hypoxiaTiana, Maria CSIC ORCID; Villar, Diego; Pérez-Guijarro, Eva; Gómez-Maldonado, Laura CSIC; Moltó, Eduardo; Fernández-Miñán, Ana CSIC ORCID; Gómez-Skarmeta, José Luis CSIC ORCID ; Montoliu, Lluís CSIC ORCID ; Peso, Luis del CSIC ORCIDartículo
7openAccessAcemelRD.pdf.jpg2016A single three-dimensional chromatin compartment in amphioxus indicates a stepwise evolution of vertebrate Hox bimodal regulationAcemel, Rafael D. CSIC ORCID; Tena, Juan J. CSIC ORCID; Irastorza-Azcárate, Ibai CSIC ORCID; Marlétaz, Ferdinand; Gómez-Marín, Carlos CSIC ORCID; Calle-Mustienes, Elisa de la CSIC ORCID; Diaz, Sergio G.; Holland, Peter W. H.; Devos, Damien P. CSIC ORCID; Maeso, Ignacio CSIC ORCID; Escrivá, Héctor CSIC ORCID; Gómez-Skarmeta, José Luis CSIC ORCID artículo
8openAccessactiveperiod.pdf.jpg2016Active DNA demethylation at enhancers during the vertebrate phylotypic periodBogdanovic, Ozren CSIC ORCID; Calle-Mustienes, Elisa de la CSIC ORCID; Tena, Juan J. CSIC ORCID; Veenstra, Gert Jan C.; Vermeulen, Michiel; Gómez-Skarmeta, José Luis CSIC ORCID ; Lister, Ryanartículo
9openAccessActive DNA demethylation_Skvortsova.pdf.jpg2-dic-2022Active DNA demethylation of developmental cis-regulatory regions predates vertebrate originsSkvortsova, Ksenia; Bertrand, Stephanie; Voronov, D.; Duckett, Paul Edward; Ross, Samuel E.; Magri, Marta Silvia CSIC ORCID; Maeso, Ignacio CSIC ORCID; Weatheritt, Robert J.; Gómez-Skarmeta, José Luis CSIC ORCID ; Ina Arnone, María; Escrivá, Héctor CSIC ORCID; Bogdanovic, Ozren CSIC ORCIDartículo
10openAccessAge-related_Alcalá_PV_Art2021.pdf.jpg13-ene-2021Age-related and disease locus-specific mechanisms contribute to early remodelling of chromatin structure in Huntington’s disease miceAlcalá-Vida, Rafael; Seguin, Jonathan; Lotz, Caroline; Molitor, Anne M.; Irastorza-Azcárate, Ibai CSIC ORCID; Awada, Ali; Karasu, Nezih; Bombardier, Aurélie; Cosquer, Brigitte; Gómez-Skarmeta, José Luis CSIC ORCID ; Cassel, Jean-Christophe; Boutillier, Anne-Laurence; Sexton, Thomas; Merienne, Karineartículo
11openAccessjournal.pgen.1001126.pdf.jpgsep-2010Allelic Variation at the 8q23.3 Colorectal Cancer Risk Locus Functions as a Cis-Acting Regulator of EIF3HNaranjo, Silvia CSIC ORCID; Alonso, M. Eva CSIC; Manzanares, Miguel CSIC ORCID; Gavilán, Angela; Gómez-Skarmeta, José Luis CSIC ORCID ; Houlston, Richard S.artículo
12openAccessAmphioxus_Marlétaz_Art_PV.pdf.jpg6-dic-2018Amphioxus functional genomics and the origins of vertebrate gene regulationMarlétaz, Ferdinand; Firbas, Panos; Maeso, Ignacio CSIC ORCID; Tena, Juan J. CSIC ORCID; Bogdanovic, Ozren CSIC ORCID; Perry, M.; Wyatt, Christopher D. R.; Calle-Mustienes, Elisa de la CSIC ORCID; Bertrand, Stephanie; Burguera, Demian; Acemel, Rafael D. CSIC ORCID; Van Heeringen, Simon J.; Naranjo, Silvia CSIC ORCID; Herrera-Úbeda, Carlos; Skvortsova, Ksenia; Jiménez-Gancedo, Sandra CSIC; Aldea, Daniel; Marquez, Yamile; Buono, Lorena CSIC ORCID; Kozmikova, Iryna; Permanyer, Jon; Louis, Alexandra; Albuixech-Crespo, Beatriz; Petillon, Yann Le; Leon, Anthony; Subirana, Lucie; Balwierz, Piotr J.; Duckett, Paul Edward; Farahani, Ensieh; Aury, Jean‐Marc; Mangenot, Sophie; Wincker, Patrick; Albalat, Ricard; Benito-Gutiérrez, Èlia; Cañestro, Cristian; Castro, Filipe; D’Aniello, Salvatore; Ferrier, David E. K.; Huang, Shengfeng; Laudet, Vincent; Marais, Gabriel A.B.; Pontarotti, Pierre; Schubert, Michael; Seitz, Hervé; Somorjai, Ildiko; Takahashi, Tokiharu; Mirabeau, Olivier; Xu, Anlong; Yu, Jr-Kai; Carninci, Piero; Martínez-Morales, Juan Ramón CSIC ORCID; Roest Crollius, Hugues; Kozmik, Zbynek; Weirauch, Matthew T.; Garcia-Fernàndez, Jordi; Lister, Ryan; Lenhard, Boris; Holland, Peter W. H.; Escrivá, Héctor CSIC ORCID; Gómez-Skarmeta, José Luis CSIC ORCID ; Irimia, Manuelartículo
13openAccessS_Campuzano_An_Ancient.pdf.jpg2012An ancient genomic regulatory block conserved across bilaterians and its dismantling in tetrapods by retrogene replacementMaeso, Ignacio CSIC ORCID; Irimia, Manuel; Tena, Juan J. CSIC ORCID; González-Pérez, Esther CSIC ORCID; Campuzano, Sonsoles CSIC ORCID; Gómez-Skarmeta, José Luis CSIC ORCID ; Garcia-Fernàndez, Jordiartículo
14openAccessPreprinpreskarmet.pdf.jpg2018An evolutionary perspective of regulatory landscape dynamics in development and diseaseFranke, Martin CSIC ORCID; Gómez-Skarmeta, José Luis CSIC ORCID artículo
15openAccesseye morphogenesis.pdf.jpg2015Analysis of opo cis-regulatory landscape uncovers Vsx2 requirement in early eye morphogenesisGago-Rodrigues, Inês CSIC; Fernández-Miñán, Ana CSIC ORCID; Letelier, Joaquin CSIC ORCID; Naranjo, Silvia CSIC ORCID; Tena, Juan J. CSIC ORCID; Gómez-Skarmeta, José Luis CSIC ORCID ; Martínez-Morales, Juan Ramón CSIC ORCIDartículo
16openAccessAncient_Touceda_PV_Art2020.pdf.jpgoct-2020Ancient Genomic Regulatory Blocks Are a Source for Regulatory Gene Deserts in Vertebrates after Whole-Genome DuplicationsTouceda-Suárez, María; Kita, Elizabeth M.; Acemel, Rafael D. CSIC ORCID; Firbas, Panos; Magri, Marta Silvia CSIC ORCID; Naranjo, Silvia CSIC ORCID; Tena, Juan J. CSIC ORCID; Gómez-Skarmeta, José Luis CSIC ORCID ; Maeso, Ignacio CSIC ORCID; Irimia, Manuelartículo
17openAccessassayATAc.pdf.jpg2020Assaying chromatin accessibility using ATAC-seq in invertebrate chordate embryosMagri, Marta Silvia CSIC ORCID; Jiménez-Gancedo, Sandra CSIC; Bertrand, Stephanie; Madgwick, Alicia; Escrivá, Héctor CSIC ORCID; Lemaire, Patrick; Gómez-Skarmeta, José Luis CSIC ORCID artículo
18openAccessAsthma-associated_Aneas_PV_Art2021.pdf.jpg2021Asthma-associated genetic variants induce IL33 differential expression through an enhancer-blocking regulatory regionAneas, Ivy; Decker, Donna C.; Howard, Chanie L.; Sobreira, Débora R.; Sakabe, Noboru J.; Blaine, Kelly M.; Stein, Michelle M.; Hrusch, Cara L.; Montefiori, Lindsey E.; Tena, Juan J. CSIC ORCID; Magnaye, Kevin M.; Clay, Selene M.; Gern, James E.; Jackson, Daniel J.; Altman, Matthew C.; Naureckas, Edward T.; Hogarth, Douglas K.; White, Steven R.; Gómez-Skarmeta, José Luis CSIC ORCID ; Schoetler, Nathan; Ober, Carole; Sperling, Anne I.; Nóbrega, Marcelo A.artículo
19openAccessBoundary_Seruggia_Art2020.pdf.jpg2020Boundary sequences flanking the mouse tyrosinase locus ensure faithful pattern of gene expressionSeruggia, Davide; Fernández, Almudena; Cantero, Marta; Fernández-Miñán, Ana CSIC ORCID; Gómez-Skarmeta, José Luis CSIC ORCID ; Pelczar, Pawel; Montoliu, Lluís CSIC ORCID artículo
20openAccessCharacterization_2010.pdf.jpg31-dic-2010Characterization of New Otic Enhancers of the Pou3f4 Gene Reveal Distinct Signaling Pathway Regulation and Spatio-Temporal PatternsRobert-Moreno, Alex; Naranjo, Silvia CSIC ORCID; Calle-Mustienes, Elisa de la CSIC ORCID; Gómez-Skarmeta, José Luis CSIC ORCID ; Alsina, Bertaartículo