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Título

Validación de los datos obtenidos en un análisis genómico y metabolómico de un modelo animal de sobreexpresión de la COX-2 en hígado

Autor Ovejero Martínez, Tamara
DirectorCasado, Marta
Fecha de publicación 28-jun-2013
EditorCSIC - Instituto de Biomedicina de Valencia (IBV)
Citación Validación de los datos obtenidos en un análisis genómico y metabolómico de un modelo animal de sobreexpresión de la COX-2 en hígado: 42 p. (2013)
Resumen[EN] Expression of cyclooxygenase 2 (COX-2) in hepatocytes is limited to those situations where occurs dedifferentiation or proliferation as regeneration after partial hepatectomy, suggesting an important role of prostaglandins (PGs) in the liver pathologies including hepatocellular carcinoma, cirrhosis or chronic infection by hepatitis virus C. To deepen the role of COX-2 in liver physiopathology was generated a model of transgenic (Tg) mice overexpressing human COX-2 specifically in adult hepatocytes. To characterize the animal model, which showed no apparent phenotype, were carried out genomic, proteomic and metabolic studies. The aim of this work was the validation of the massive data analysis. Were analyzed by real-time quantitative PCR a total of 7 genes which were overexpressed in the transgenic model or explaining changes in metabolites tested. None of the studied genes showed significant differences , having to be consider as false positives. This study confirms the need to validate mass data analysis even when gene analysis or candidate gene onthology seems conclusive.
[ES]La expresión de la ciclooxigenasa 2 (COX-2) en hepatocitos se limita a aquellas situaciones en las que se produce desdiferenciación o proliferación como en la regeneración tras hepatectomía parcial, lo que sugiere un papel importante de las prostaglandinas en la aparición de patologías hepáticas incluyendo el carcinoma hepatocelular, cirrosis, o infección crónica por el virus de la hepatitis C. Para profundizar en el papel de COX-2 en la fisiopatología hepática, se generó un animal transgénico de sobreexpresión del enzima humano específicamente en hepatocitos adultos. Para caracterizar el modelo animal, que no mostraba un fenotipo aparente, se llevaron a cabo estudios genómicos, proteómicos y metabolómicos. El objetivo del trabajo de tesis fue la validación de los datos de análisis masivos. Se analizaron, mediante PCR cuantitativa a tiempo real, un total de genes que estaban sobreexpresados en el modelo transgénico o que explicaban las variaciones en los metabolitos analizados. Ninguno de los genes estudiados mostraron diferencias significativas teniendo que ser considerados como falsos positivos. Este trabajo confirma la necesidad de validar los datos de análisis masivos incluso cuando los análisis de gen onthology o de gen candidato sean concluyentes.
Descripción Trabajo final de Master: "Aproximaciones Moleculares en ciencias de la salud": 42 p. figuras y tablas
URI http://hdl.handle.net/10261/97330
Aparece en las colecciones: (IBV) Tesis
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