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Title

Genetic diversity in Silene sennenii Pau (Caryophyllaceae) assayed through DNA-based techniques

AuthorsLópez-Vinyallonga, Sara ; López-Pujol, Jordi ; Martinell Andreu, M. Carmen; Massó, Sergi ; Blanché, Cèsar
KeywordsAFLPs
Chloroplast haplotype
Cross amplification
Endemism
Microsatellites
SSRs
Amplificación cruzada
Endemismo
Haplotipo cloroplástico
Microsatélites
Issue DateDec-2012
PublisherConsejo Superior de Investigaciones Científicas (España)
CitationCollectanea Botanica 31 :7-18 (2012)
Abstract[EN]Genetic diversity in Silene sennenii Pau (Caryophylaceae) asayed through DNA-based techniques.— Silene sennenii is a narrow endemic species from the NE of the Iberian Peninsula. It is considered as EN (“Endangered”) according to the IUCN criteria and is under legal protection in Catalonia. In the present work we report an assay using three different approaches for surveying the genetic diversity in this rare, endangered campion: analysis of chloroplast haplotypes, AFLPs and transferability of microsatellites previously developed for Silene latifolia. None of the nine chloroplast regions sequenced showed any variability. Five out of the 21 microsatellite loci tested were polymorphic although more loci are required in order to perform a robust population genetics study. Regarding the AFLP analysis, five out of the 26 pairs of primers tested exhibited moderate levels of variability and therefore they could be useful for further investigating the genetic structure of S. sennenii. Although preliminary, our results based on three different genetic markers are in agreement with the low values of genetic variation already reported for this species employing allozymes.
[ES]Diversidad genética de Silene sennenii Pau (Caryophyllaceae) a partir de técnicas basadas en ADN.— Silene sennenii es una especie endémica, circunscrita a un área extremadamente reducida al NE de la Península Ibérica. Está catalogada como EN («En Peligro») según criterios UICN y se encuentra legalmente protegida en Cataluña. En el presente trabajo se expone el ensayo de tres aproximaciones diferentes al estudio de su diversidad genética: análisis de haplotipos cloroplásticos, AFLPs y transferibilidad de microsatélites diseñados previamente para Silene latifolia. Ninguna de las nueve regiones cloroplásticas secuenciadas ha presentado variabilidad. Se han obtenido cinco loci microsatélites polimórficos de los 21 ensayados, cantidad insuficiente para llevar a cabo un estudio robusto sobre genética poblacional. En cuanto a AFLPs, cinco combinaciones de cebadores de las 26 probadas han mostrado niveles moderados de variabilidad siendo así útiles para posteriores trabajos sobre la estructura genética de S. sennenii. Aun siendo preliminares, los resultados aquí expuestos, fruto del uso de tres tipos de marcadores basados en ADN, confirman la escasa diversidad genética anteriormente obtenida para esta especie mediante la técnica de electroforesis de aloenzimas.
Description15 p.
Publisher version (URL)http://dx.doi.org/10.3989/collectbot.2012.v31.001
URIhttp://hdl.handle.net/10261/64598
DOI10.3989/collectbot.2012.v31.001
ISSN0010-0730
E-ISSN1989-1067
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