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http://hdl.handle.net/10261/49474
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Título: | Microsatellite cross-species amplification in the genus Centaurea (Compositae). |
Otros títulos: | Amplificación cruzada de microsatélites en el género Centaurea (Compositae). | Autor: | López-Vinyallonga, Sara CSIC; López-Alvarado, Javier; Constantinidis, T. H.; Susanna de la Serna, Alfonso CSIC ORCID ; Garcia-Jacas, Núria CSIC ORCID | Palabras clave: | Chloroplast microsatellites Conservation cross-amplification interspecific amplification narrow endemics SSR transferability universal markers Amplificación cruzada amplificación interespecífica Conservación marcadores universales microendemismos microsatélites cloroplásticos |
Fecha de publicación: | 2011 | Editor: | Consejo Superior de Investigaciones Científicas (España) | Citación: | Collectanea Botanica 30: 17-27 (2011) | Resumen: | [EN] Microsatellites are widely used for population
genetic studies although the development of these species-specific markers is costly and time-consuming. One strategy for
saving time and money is the use of markers developed for one species (source species) in a different species (target species).
This is known as cross-amplification. In the present work, two sets of microsatellites are used to test their transferability to six
narrow endemic Centaurea species: i) 16 nuclear loci previously published for three congeneric species and ii) 10 universal
chloroplast markers designed from Nicotiana tabacum sequences. Seventeen of the 26 markers tested were transferable and
14 of them were also polymorphic and therefore useful for future works. Nuclear markers were more variable and thus more
informative than chloroplast markers. Interspecific amplification performed better for the nuclear loci developed for different
Centaurea species than for the universal chloroplast markers developed for Nicotiana tabacum. Likewise, transferability was
more successful for the species from sect. Phalolepis than for sect. Lepteranthus. Therefore, our results support the idea that
the success of the cross-amplification is influenced by the evolutionary distance between the target and the source species. [ES] Los microsatélites se usan habitualmente en estudios de genética de poblaciones aunque su desarrollo es un proceso caro y largo dada su elevada especificidad. Una estrategia que permite ahorrar tiempo y dinero es la llamada amplificación cruzada que consiste en amplificar el DNA de una especie determinada (especie objetivo) usando marcadores que han sido diseñados para una especie diferente (especie fuente). En este trabajo se ha realizado un ensayo sobre amplificación cruzada usando seis endemismos del género Centaurea y dos conjuntos de microsatélites: i) 16 marcadores nucleares desarrollados para tres especies congenéricas y ii) 10 marcadores cloroplásticos universales diseñados para Nicotiana tabacum. Diecisiete de los 26 marcadores evaluados resultaron transferibles, de los cuales 14 fueron polimórficos siendo así útiles para futuros trabajos. Las regiones nucleares se mostraron más variables y por lo tanto más informativas que las cloroplásticas. La amplificación cruzada funcionó mejor para los marcadores nucleares específicos de Centaurea que para los cloroplásticos universales específicos de Nicotiana tabacum. A su vez, se obtuvo mejor resultado para las especies de la sección Phalolepis que para las de la sección Lepteranthus. En consecuencia, nuestros resultados apoyan la idea de que el éxito de la amplificación cruzada está estrechamente ligado a la distancia evolutiva entre especie fuente y especie objetivo. |
Descripción: | 11p. Fotog. en color. Tablas. | Versión del editor: | http://dx.doi.org/10.3989/collectbot.2011.v30.002 | URI: | http://hdl.handle.net/10261/49474 | DOI: | 10.3989/collectbot.2011.v30.002 | ISSN: | 0010-0730 |
Aparece en las colecciones: | (IBB) Artículos |
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