English   español  
Please use this identifier to cite or link to this item: http://hdl.handle.net/10261/49474
Share/Impact:
Statistics
logo share SHARE logo core CORE   Add this article to your Mendeley library MendeleyBASE

Visualizar otros formatos: MARC | Dublin Core | RDF | ORE | MODS | METS | DIDL | DATACITE
Exportar a otros formatos:

Title

Microsatellite cross-species amplification in the genus Centaurea (Compositae).

Other TitlesAmplificación cruzada de microsatélites en el género Centaurea (Compositae).
AuthorsLópez-Vinyallonga, Sara CSIC; López-Alvarado, Javier; Constantinidis, T. H.; Susanna de la Serna, Alfonso CSIC ORCID ; Garcia-Jacas, Núria CSIC ORCID
Keywordschloroplast microsatellites
conservation
cross-amplification
interspecific amplification
narrow endemics
SSR
transferability
universal markers
Amplificación cruzada
amplificación interespecífica
conservación
marcadores universales
microendemismos
microsatélites cloroplásticos
Issue Date2011
PublisherConsejo Superior de Investigaciones Científicas (España)
CitationCollectanea Botanica 30: 17-27 (2011)
Abstract[EN] Microsatellites are widely used for population genetic studies although the development of these species-specific markers is costly and time-consuming. One strategy for saving time and money is the use of markers developed for one species (source species) in a different species (target species). This is known as cross-amplification. In the present work, two sets of microsatellites are used to test their transferability to six narrow endemic Centaurea species: i) 16 nuclear loci previously published for three congeneric species and ii) 10 universal chloroplast markers designed from Nicotiana tabacum sequences. Seventeen of the 26 markers tested were transferable and 14 of them were also polymorphic and therefore useful for future works. Nuclear markers were more variable and thus more informative than chloroplast markers. Interspecific amplification performed better for the nuclear loci developed for different Centaurea species than for the universal chloroplast markers developed for Nicotiana tabacum. Likewise, transferability was more successful for the species from sect. Phalolepis than for sect. Lepteranthus. Therefore, our results support the idea that the success of the cross-amplification is influenced by the evolutionary distance between the target and the source species.
[ES] Los microsatélites se usan habitualmente en estudios de genética de poblaciones aunque su desarrollo es un proceso caro y largo dada su elevada especificidad. Una estrategia que permite ahorrar tiempo y dinero es la llamada amplificación cruzada que consiste en amplificar el DNA de una especie determinada (especie objetivo) usando marcadores que han sido diseñados para una especie diferente (especie fuente). En este trabajo se ha realizado un ensayo sobre amplificación cruzada usando seis endemismos del género Centaurea y dos conjuntos de microsatélites: i) 16 marcadores nucleares desarrollados para tres especies congenéricas y ii) 10 marcadores cloroplásticos universales diseñados para Nicotiana tabacum. Diecisiete de los 26 marcadores evaluados resultaron transferibles, de los cuales 14 fueron polimórficos siendo así útiles para futuros trabajos. Las regiones nucleares se mostraron más variables y por lo tanto más informativas que las cloroplásticas. La amplificación cruzada funcionó mejor para los marcadores nucleares específicos de Centaurea que para los cloroplásticos universales específicos de Nicotiana tabacum. A su vez, se obtuvo mejor resultado para las especies de la sección Phalolepis que para las de la sección Lepteranthus. En consecuencia, nuestros resultados apoyan la idea de que el éxito de la amplificación cruzada está estrechamente ligado a la distancia evolutiva entre especie fuente y especie objetivo.
Description11p. Fotog. en color. Tablas.
Publisher version (URL)http://dx.doi.org/10.3989/collectbot.2011.v30.002
URIhttp://hdl.handle.net/10261/49474
DOIhttp://dx.doi.org/10.3989/collectbot.2011.v30.002
ISSN0010-0730
Appears in Collections:(IBB) Artículos
Files in This Item:
File Description SizeFormat 
Vinyallonga_Microsatelites.pdf414,79 kBAdobe PDFThumbnail
View/Open
Show full item record
Review this work
 


WARNING: Items in Digital.CSIC are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.