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A finales del año 1999, el CSIC creó el Instituto de Ciencias del Espacio (ICE) con el objeto de articular administrativamente su participación en el IEEC. Como instituto propio del CSIC y unidad del IEEC, el Instituto de Ciencias del Espacio tiene como misión contribuir de manera significativa a la investigación científica i tecnológica de y desde el espacio, poniendo especial énfasis en la instrumentación a bordo de satélites así como en las técnicas asociadas con dichos instrumentos. Dentro de este marco, el ICE es activo en las siguientes disciplinas: Astrofísica y Cosmología, Ciencias de la Tierra y Física Fundamental.
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