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http://hdl.handle.net/10261/239110
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Campo DC | Valor | Lengua/Idioma |
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dc.contributor.author | Schoch, C. | es_ES |
dc.contributor.author | Seifert, K. A. | es_ES |
dc.contributor.author | Huhndorf, S. | es_ES |
dc.contributor.author | Zamora, Juan Carlos | es_ES |
dc.contributor.author | Tellería, M. T. | es_ES |
dc.contributor.author | Pino Bodas, Raquel | es_ES |
dc.contributor.author | Martín, María P. | es_ES |
dc.date.accessioned | 2021-04-22T10:35:00Z | - |
dc.date.available | 2021-04-22T10:35:00Z | - |
dc.date.issued | 2012-04-17 | - |
dc.identifier.citation | Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA. 109 (16): 5907-6354 | es_ES |
dc.identifier.issn | 0027-8424 | - |
dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/10261/239110 | - |
dc.description | Se evaluaron seis regiones de ADN como posibles códigos de barras de ADN para Hongos, el segundo reino más grande de vida eucariota, por un consorcio multinacional y de laboratorios múltiples. La región de la mitocondria se utilizó la subunidad 1 de la citocromo c oxidasa como código de barras animal excluido como un marcador potencial, porque es difícil de amplificar en hongos, a menudo incluye intrones grandes y puede ser insuficientemente variable. Tres subunidades del cistrón de ARN ribosómico nuclear fueron en comparación con las regiones de tres genes de codificación proteica representativos (la subunidad más grande de la ARN polimerasa II, la segunda más grande subunidad de la ARN polimerasa II y mantenimiento de minicromosomas proteína). Aunque las regiones de genes que codifican proteínas a menudo tenían un porcentaje más alto de identificación correcta en comparación con ribosomal marcadores, baja amplificación por PCR y éxito de secuenciación eliminados ellos como candidatos para un código de barras universal para hongos. Entre la regiones del cistrón ribosómico, el espaciador transcrito interno (ITS) tiene la mayor probabilidad de identificación exitosa para la gama más amplia de hongos, con la brecha de código de barras más claramente definida entre la variación inter e intraespecífica. El nuclear subunidad ribosómica grande, un marcador filogenético popular en ciertos grupos, tuvieron una resolución de especies superior en algunos grupos taxonómicos, como los primeros linajes divergentes y las levaduras ascomicetas, pero por lo demás era ligeramente inferior al ITS. El ribosomal nuclear La subunidad pequeña tiene una resolución pobre a nivel de especie en los hongos. SU será propuesto formalmente para su adopción como el código de barras fúngico principal marcador al Consorcio para el Código de Barras de la Vida, con la posibilidad de que se desarrollen códigos de barras suplementarios para grupos taxonómicos estrechamente circunscritos. | es_ES |
dc.description.abstract | Six DNA regions were evaluated as potential DNA barcodes for Fungi, the second largest kingdom of eukaryotic life, by a multinational, multilaboratory consortium. The region of the mitochondrial cytochrome c oxidase subunit 1 used as the animal barcode was excluded as a potential marker, because it is difficult to amplify in fungi, often includes large introns, and can be insufficiently variable. Three subunits from the nuclear ribosomal RNA cistron were compared together with regions of three representative proteincoding genes (largest subunit of RNA polymerase II, second largest subunit of RNA polymerase II, and minichromosome maintenance protein). Although the protein-coding gene regions often had a higher percent of correct identification compared with ribosomal markers, low PCR amplification and sequencing success eliminated them as candidates for a universal fungal barcode. Among the regions of the ribosomal cistron, the internal transcribed spacer (ITS) region has the highest probability of successful identification for the broadest range of fungi, with the most clearly defined barcode gap between inter- and intraspecific variation. The nuclear ribosomal large subunit, a popular phylogenetic marker in certain groups, had superior species resolution in some taxonomic groups, such as the early diverging lineages and the ascomycete yeasts, but was otherwise slightly inferior to the ITS. The nuclear ribosomal small subunit has poor species-level resolution in fungi. ITS will be formally proposed for adoption as the primary fungal barcode marker to the Consortium for the Barcode of Life, with the possibility that supplementary barcodes may be developed for particular narrowly circumscribed taxonomic groups. | es_ES |
dc.language.iso | eng | es_ES |
dc.publisher | National Academy of Sciences (U.S.) | es_ES |
dc.relation.isversionof | Publisher's version | es_ES |
dc.rights | openAccess | es_ES |
dc.subject | Fungi | es_ES |
dc.subject | DNA barcodes | es_ES |
dc.title | Nuclear ribosomal internal transcribed spacer (ITS) region as a universal barcode marker for Fungi | es_ES |
dc.type | artículo | es_ES |
dc.description.peerreviewed | Peer reviewed | es_ES |
dc.relation.publisherversion | https://doi.org/10.1073/pnas.1117018109 | es_ES |
dc.identifier.e-issn | 1091-6490 | - |
dc.rights.license | https://v2.sherpa.ac.uk/id/publication/10338 | es_ES |
dc.contributor.funder | Ontario Genomics Institute | es_ES |
dc.relation.csic | Sí | es_ES |
oprm.item.hasRevision | no ko 0 false | * |
dc.identifier.funder | http://dx.doi.org/10.13039/501100000092 | es_ES |
dc.type.coar | http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 | es_ES |
item.languageiso639-1 | en | - |
item.fulltext | With Fulltext | - |
item.openairecristype | http://purl.org/coar/resource_type/c_18cf | - |
item.cerifentitytype | Publications | - |
item.grantfulltext | open | - |
item.openairetype | artículo | - |
Aparece en las colecciones: | (RJB) Artículos |
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