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Title

Genome annotation, comparative genomics and evolution of the model grass genus Brachypodium (Poaceae)

AuthorsSancho Cohen, Rubén
AdvisorCatalán Rodríguez, Pilar; Contreras-Moreira, Bruno
KeywordsBiogeografía botánica
Genética molecular de plantas
Issue DateJun-2018
PublisherUniversidad de Zaragoza
CitationTesis doctorales EEAD-CSIC
SeriesTD-2018-6
Abstract[EN] The ample use of Brachypodium distachyon as model plant for temperate grasses and the vaste availability of pangenomic resources stimulated us to conduct analysis of coexpression networks and of differentially expressed genes under drought and water conditions among a large geographic sampling of its ecotypes. The results detected groups of regulatory hub genes implied in the response to the drought stress (synthesis of proline, responses to water deprivation, phosphate starvation and stimulus to temperature) that could also be key in the regulation of other signaling pathways and on the response to other stresses. The compilation of studies developed in this thesis has contributed to increase the current knowledge on the evolution and functional responses of species of the genus Brachypodium.
[ES] El amplio uso de Brachypodium distachyon como planta modelo de gramíneas templadas y la amplia disponibilidad de recursos pan-genómicos de esta especie nos ha incitado a llevar a cabo estudios de redes de co-expresión génica y de expresión diferencial de genes en condiciones de sequía y de riego entre una amplia muestra geográfica de sus ecotipos. Los resultados nos han permitido identificar conjuntos de genes reguladores de rutas biológicas implicadas en las respuesta al estrés hídrico (síntesis de prolina, respuesta a la privación de agua, a la de fosfato inorgánico y de estímulo de la temperatura) que pueden ser también claves en procesos celulares de señalización y de respuesta a otros estreses. El conjunto de los estudios de la tesis han dado lugar a un incremento en el conocimiento sobre el género Brachypodium, tanto a nivel evolutivo como funcional.
Description341 Pags.- Figs.- Tabls. Tesis Univ. Zaragoza, Departamento de Ciencias Agrarias y del Medio Natural; Estación Experimental de Aula Dei (EEAD-CSIC). Bajo la dir. de los Drs. Pilar Catalán (UniZar) y Bruno Contreiras-Moreira (EEAD-CSIC).
URIhttp://hdl.handle.net/10261/174792
Appears in Collections:(EEAD) Tesis
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