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Título

Implicación del pequeño ARN SuhB en la represión catabólica de los genes de degradación de tetralina en Sphingopyxis granuli estirpe TFA

AutorGarcía-Romero, Inmaculada; Santero, Eduardo ; Floriano Pardal, Belén
Fecha de publicación2016
EditorSociedad Española de Microbiología
CitaciónXI Reunión Microbiología Molecular (2016)
ResumenSphingopyxis granuli estirpe TFA es una bacteria Gram-negativa de la familia de las α- proteobacterias capaz de utilizar el solvente orgánico tetralina como única fuente de carbono y energía. Los genes estructurales (genes thn) se organizan en dos operones divergentes (B y C) que se inducen en presencia de tetralina. Formando parte del operón C se encuentran los genes reguladores thnR, que codifica un regulador tipo LysR, y thnY, que codifica un co-activador de ThnR. En ausencia de tetralina, thnRY tienen una expresión basal desde un promotor interno constitutivo. Además de la inducción en presencia de tetralina, la expresión de los genes thn está sujeta a represión catabólica por fuente de carbono preferencial (RCC). El mecanismo de activación específica se ha estudiado en profundidad, si bien aún no se conocen los elementos implicados en la represión de los genes thn cuando en el medio, además de tetralina, está presente otra fuente de carbono preferencial, como el β-hidroxibutirato (βHB). Los únicos mutantes obtenidos hasta el momento muestran una desrepresión parcial y están afectados en la síntesis del gránulo de reserva de polihidroxibutirato. La comparación de la expresión génica global en células crecidas en tetralina o en β-HB puso de manifiesto la presencia de un pequeño ARN (sRNA) con expresión preferencial en células crecidas en βHB, predicho en el genoma de TFA por el software Infernal 1.1 y perteneciente a la familia RF00519 (SuhB) sólo descrita en α-proteobacterias. En un mutante carente de SuhB los genes thn se encuentran parcialmente desreprimidos en condiciones de represión catabólica. La búsqueda de posibles dianas de SuhB utilizando el software IntaRNA identificó, entre otros, al extremo 5’ del mRNA de thnR, localizándose la interacción de SuhB en la región de unión al ribosoma. El efecto de esta posible interacción sobre los niveles de ThnR se ha analizado mediante Western Blot en condiciones de represión catabólica, detectándose más cantidad de ThnR en la estirpe mutante que en la silvestre. Los datos disponibles hasta el momento indican que SuhB es uno de los elementos que interviene en la represión catabólica de los genes thn en Sphingopyxis granuli estirpe TFA.
DescripciónPóster presentado a la XI Reunión del Grupo de Microbiología Molecular, celebrada en Sevilla del 6 al 8 de septiembre de 2016.
URIhttp://hdl.handle.net/10261/163792
Aparece en las colecciones: (CABD) Comunicaciones congresos
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