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SeDuS: segmental duplication simulator

AutorHartasánchez Frenk, Diego ; Brasó-Vives, Marina ; Fuentes-Díaz, Juanma; Vallès-Codina, Oriol; Navarro, Arcadi
Fecha de publicación1-ene-2016
EditorOxford University Press
CitaciónBioinformatics 32(1): 148-150 (2015)
ResumenSummary: SeDuS is the first flexible and user-friendly forward-in-time simulator of patterns of molecular evolution within segmental duplications undergoing interlocus gene conversion and crossover. SeDuS introduces known features of interlocus gene conversion such as biased directionality and dependence on local sequence identity. Additionally, it includes aspects such as different selective pressures acting upon copy number and flexible crossover distributions. A graphical user interface allows fast fine-tuning of relevant parameters and straightforward real-time analysis of the evolution of duplicates.
Versión del editorhttps://doi.org/10.1093/bioinformatics/btv481
URIhttp://hdl.handle.net/10261/152571
DOI10.1093/bioinformatics/btv481
ISSN1460-2059
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