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Título

Parmbsc1: A refined force field for DNA simulations

AutorIvani, I.; Dans, P.D.; Noy, A.; Pérez, A.; Faustino, I.; Hospital, A.; Walther, J.; Andrio, P.; Goñi, R.; Balaceanu, A.; Portella, G.; Battistini, F.; Gelpí, J.L.; González, Carlos ; Vendruscolo, M.; Laughton, C.A.; Harris, S.A.; Case, D.A.; Orozco, Modesto
Fecha de publicación2015
EditorNature Publishing Group
CitaciónNature Methods 13: 55- 58 (2015)
ResumenWe present parmbsc1, a force field for DNA atomistic simulation, which has been parameterized from high-level quantum mechanical data and tested for nearly 100 systems (representing a total simulation time of ∼140 1/4s) covering most of DNA structural space. Parmbsc1 provides high-quality results in diverse systems. Parameters and trajectories are available at http://mmb.irbbarcelona.org/ParmBSC1/.
URIhttp://hdl.handle.net/10261/141974
DOI10.1038/nmeth.3658
Identificadoresdoi: 10.1038/nmeth.3658
issn: 1548-7105
Aparece en las colecciones: (IQFR) Artículos
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