Accessing genetic variability in Spanish barleys through high-throughput sequencing

Abstract

[EN] High-throughput sequencing (HTS) has revolutionized plant research. It has made it possible to sequence the genomes of multiple organisms. The sequence-enriched physical map of barley was published in late 2012. A first step to exploit barley genomics, for practical purposes, was facilitating geneticists and breeders access to the barley physical map. This was the aim which led us to the development of Barleymap, a software tool which allows locating genetic markers in the barley physical-genetic map. This application effectively integrates and maps markers from different widely used barley genotyping platforms, and, in general, any marker with sequence information.

[ES] La secuenciación de alto rendimiento (HTS, por sus siglas en inglés) ha revolucionado la investigación, haciendo posible secuenciar los genomas de múltiples organismos. El mapa físico de cebada y sus secuencias asociadas fueron publicados a finales de 2012. Para sacar partido de estos recursos, había que facilitar el acceso a ellos a genetistas y mejoradores. Este fue el objetivo que nos llevó a desarrollar Barleymap, una herramienta informática que permite localizar marcadores genéticos en el genoma de cebada. La aplicación integra y localiza marcadores de distintas plataformas de genotipado de cebada ampliamente utilizadas.