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Título

Aplicación de gradientes de densidad en el aislamiento de microbiota fecal

AutorHevia, Arancha ; Margolles Barros, Abelardo ; Sánchez García, Borja
Fecha de publicación5-jul-2015
CitaciónVI Workshop Probióticos, Prebióticos y Salud: Evidencia Científica (2015)
ResumenEn este trabajo se muestra que la separación de microorganismos del resto de matriz fecal presente en las heces, mediante el uso de gradientes de densidad con resina Nycodenz ®, no afecta globalmente al perfil de microbiota del donante comparado con la muestra sin tratar. Para ello se obtuvieron muestras fecales de pacientes con Lupus Eritematoso Sistémico (LES) y donantes sanos. La microbiota se separó del resto del material fecal en un solo paso de centrifugación a través del gradiente de densidad, se extrajo el ADN, y se utilizó un método optimizado de análisis basado en la amplificación parcial del gen del 16S rRNA para determinar el perfil microbiano. La comparación de estos perfiles evidenció una ausencia de efecto de la extracción en gradiente sobre los grupos bacterianos mayoritarios. Complementariamente, los perfiles microbianos se agruparon usando diferentes métodos de ordenación y reducción dimensional y se calcularon las matrices de similitud entre muestras. Como regla general, se observó un agrupamiento entre sí de las muestras aisladas/no aisladas, lo que sugiere que las comunidades microbianas aisladas utilizando gradientes de Nycodenz® son representativas de aquellas presentes en las heces de origen. En resumen, este trabajo proporciona un protocolo sencillo para la separación de microbiota fecal del resto de materia fecal.
DescripciónTrabajo presentado en el VI Workshop Probióticos, Prebióticos y Salud: Evidencia Científica, celebrado en Oviedo, España, el 5 y 6 de febrero de 2015
URIhttp://hdl.handle.net/10261/141602
Aparece en las colecciones: (IPLA) Comunicaciones congresos
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