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Título

Two-dimensional agarose gel electrophoresis of DNA topoisomers

AutorRoca, Joaquim
Palabras claveDNA supercoiling
DNA linking number
DNA twist
DNA writhe
chloroquine
Z-DNA
Fecha de publicación7-ago-2009
EditorHumana Press
CitaciónMethods in molecular biology 582: 27-37 (2009)
ResumenThe electrophoretic velocity of a duplex DNA ring is mainly determined by its overall shape. Consequently, DNA topoisomers of opposite supercoiling handedness can have identical gel velocity, and topoisomers highly supercoiled cannot be separated beyond some point. These problems are overcome by two-dimensional agarose gel electrophoresis, which involves two successive electrophoresis steps in one gel slab. The first and second electrophoresis steps are conducted in orthogonal directions with different concentrations of DNA intercalating agents. These compounds alter the overall shape of the DNA and, thereby, change the relative mobility of individual DNA topoisomers.
DescripciónCapítulo en: Duncan J. Clarke (ed.). DNA Topopisomerases : Methodes and Protocols. [S.l.]: Humana Press, 2009, p.23-37. (Methods in molecular biology ; 582, ISSN 1064-3745). ISBN 978-1-60761-339-8. ISBN 978-1-60761-340-4. DOI 10.1007/978-1-60761-340-4_3
Versión del editorhttp://dx.doi.org/10.1007/978-1-60761-340-4_3
URIhttp://hdl.handle.net/10261/116987
DOI10.1007/978-1-60761-340-4_3
ISBN978-1-60761-339-8
978-1-60761-340-4
Identificadoresdoi: 10.1007/978-1-60761-340-4_3
e-issn: 1940-6029
issn: 1064-3745
Aparece en las colecciones: (IBMB) Artículos
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