English   español  
Por favor, use este identificador para citar o enlazar a este item: http://hdl.handle.net/10261/100689
Compartir / Impacto:
Estadísticas
Add this article to your Mendeley library MendeleyBASE
Ver citas en Google académico
Visualizar otros formatos: MARC | Dublin Core | RDF | ORE | MODS | METS | DIDL
Exportar otros formatos: Exportar EndNote (RIS)Exportar EndNote (RIS)Exportar EndNote (RIS)
Título

Patterns in marine microbial community structure

Otros títulosPatrones de estructura de las comunidades de microorganismos marinos
Autor Lefort, Thomas
DirectorGasol, Josep M.
Fecha de publicación 2012
EditorUniversidad de Las Palmas de Gran Canaria
Resumen[EN] Understanding the distribution of the different picoplankton groups represents a central tenet of marine microbial ecology. Centering our study on the three major groups constituting the bulk picoplankton community (size 0.2-3 mm), we sought to analyze the distribution of autotrophic bacteria (Synechococcus and Prochlorococcus), photosynthetic Picoeukaryotes pPeuk, and heterotrophic bacteria. For that objective, two different strategies were used, the first one was based on flow cytometry for determining ataxonomic patterns in picoplankton distribution, and the second a comparative analysis approach for identifying broad patterns in bacterial phylogenetic community structure. Given that conversion factors (CFs) were necessary to translate group cell abundance into carbon biomass, but that large discrepancies for CF values of pPeuk had been reported in the literature, we first (re-) evaluated the CF for small phototrophic picoeukaryotes (<5 mm). On one hand, as the set of cultures of Peuk used for that purpose were maintained in non-axenic conditions, we compared two different methods for correcting errors in biomass estimation due to presence of bacteria. Secondly, a relatively higher CF value for pPeuk than those previously reported to date was found, with implications on the role generally attributed to pPeuk in the carbon cycling and other ecosystem processes. Applying this CF, we could identify patterns of variability in picoplankton group distribution at different spatio-temporal scales during winter in a NW Mediterranean coastal station and during a cruise performed in summer from coast to offshore off the Catalan coast. By focusing on the variability at the short time scale, our work showed not only evidences of coupling between picophytoplankton variability and the single-cell bacterial activities but also highlighted how a relatively small variation in meteorology changed considerably the structure of the microbial community. Different trends of variability were observed between the different picoplankton groups, pPeuk cell numbers exhibiting the highest spatio-temporal variability, and bacterial abundance the lowest. Opposite patterns between picoplankton community structure and chlorophyll a levels were observed not only spatially, but also at both the short-term and large temporal scale, suggesting that picoplankton group distribution are useful indicators of the ecosystem state. Finally, we assessed the biogeography of the bacterial phylogenetic groups along a continuum of environmental parameters such as chlorophyll a, temperature and salinity, and identified different patterns in bacterial community structure as related to phytoplankton biomass among coastal and open ocean ecosystems, suggesting unequal metabolic aptitudes of the different bacterial groups for utilizing algal-derived DOC
[ES] La comprensión de la distribución de los distintos grupos que forman el picoplancton representa una de las preguntas fundamentales de la ecología microbiana marina. Centrando nuestro estudio en los tres grupos principales que constituyen la comunidad de picoplancton (tamaño de 0,2 a 3 mm), hemos tratado de analizar la distribución de bacterias autótrofas (Synechococcus y Prochlorococcus), picoeucariotas fotosintéticos (pPeuk) y bacterias heterotróficas. Con ese objetivo, se utilizaron dos estrategias distintas: la primera se basa en la citometría de flujo para la determinación de los patrones ataxonómicos de distribución de picoplancton y la segunda, un análisis comparativo para la identificación de patrones generales en la estructura filogenética de la comunidad bacteriana. Teniendo en cuenta que son necesarios factores de conversión para transformar la abundancia de los grupos de células en biomasa, pero que se registran en la literatura grandes discrepancias en los valores de factor de conversión para pPeuk, en primer lugar (re-) evaluamos el factor de conversión para picoeucariotas fototróficos pequeños (menores de 5 mm) . Por un lado, como el conjunto de los cultivos de Peuk utilizados para este fin se mantienen en condiciones no axénicas, se compararon dos métodos diferentes para la corrección de errores en la estimación de la biomasa debido a la presencia de bacterias. Encontramos un valor relativamente más alto para el factor de conversión de los pPeuk que los publicados hasta la fecha, lo que implica consecuencias considerables sobre la función generalmente atribuida a los pPeuk en el ciclo del carbono. La aplicación de este factor de conversión, permitió identificar los patrones de variabilidad en la distribución de los grupos de picoplancton a diferentes escalas espacio-temporales durante el invierno en una estación costera y en el Mediterráneo noroccidental durante una campaña realizada en el verano de costa a mar abierto en el Mar Catalano-Balear. Al centrarnos en la variabilidad temporal, nuestro trabajo mostró evidencias de acoplamiento entre la variabilidad del picofitoplancton y la actividad de las bacterias, pero también puso de relieve cómo una variación relativamente pequeña en la meteorología cambió considerablemente la estructura de la comunidad microbiana. Diferentes patrones de variabilidad se detectaron entre los grupos diferentes de picoplancton, las abundancias de pPeuk exhibieron la variabilidad espacio-temporal más alta y la abundancia bacteriana, la más baja. Patrones opuestos entre la estructura de la comunidad de picoplancton y los niveles de clorofila a se observaron no sólo espacialmente, sino también en la escala temporal a corto plazo y en la escala a largo plazo, con lo que se sugiere que la composición de la comunidad de picoplancton es un buen indicador del estado del ecosistema. Por último, evaluamos la biogeografía de los grupos filogenéticos bacterianos a lo largo de un continuo de parámetros ambientales, tales como la clorofila a, temperatura y salinidad, y se identificaron patrones diferentes en la estructura de la comunidad bacteriana y la cantidad de fitoplancton entre los ecosistemas costeros y de mar abierto, lo que sugiere aptitudes metabólicas desiguales en los diferentes grupos bacterianos a la hora de utilizar materia orgánica disuelta derivada de las algas
Descripción Memoria de tesis doctoral presentada por Thomas Lefort para obtener el grado de Doctor en Oceanografía por la Universidad de las Palmas de Gran Canaria (ULPGC), Departamento de Biología, bieno (2006-2008), realizada bajo la dirección del Dr. Josep Mª Gasol Piqué del Institut de Ciències del Mar (ICM-CSIC).-- 261 pages
URI http://hdl.handle.net/10261/100689
Aparece en las colecciones: (ICM) Tesis
Ficheros en este ítem:
Fichero Descripción Tamaño Formato  
Lefort_Tesis_2012.pdf5,53 MBAdobe PDFVista previa
Visualizar/Abrir
Mostrar el registro completo
 


NOTA: Los ítems de Digital.CSIC están protegidos por copyright, con todos los derechos reservados, a menos que se indique lo contrario.