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Firma en Digital.CSIC (*)
Matus, José Tomás
 
Centro o Instituto
CSIC - Instituto de Biología Integrativa de Sistemas (I2SysBio)
 
Departamento
Orquestación Transcripcional del Metabolismo
 
Categoría Profesional
Investigador Programa Ramón y Cajal
 
Especialización
Tomás Matus es biólogo vegetal y doctor en Ciencias Agrícolas (PUC, Chile), interesado en el uso de herramientas genómicas y de biología de sistemas para el estudio de la regulación redes de desarrollo y metabolismo de las plantas. Ha sido postdoc en el Centro de Investigación en Genómica Agrícola (CRAG, 2008-2013, 2015-2019), en el laboratorio de José Luis Riechmann, adquiriendo experiencia en tecnologías ómicas para entender el desarrollo de las flores en Arabidopsis. Recientemente comenzó una línea de investigación en biología de sistemas de cultivos frutales, utilizando el desarrollo de los frutos del tomate y la vid como modelos para entender la morfogénesis, el crecimiento y la maduración de frutos climatéricos y no climatéricos (Grupo de Investigación Orquestación Transcripcional del Metabolismo). Recibió una beca EMBO de postdoctorado de larga duración (2010-2012) y ahora se acaba de incorporar al Instituto de Biología Integrativa de Sistemas I2SysBio (Universitat de València-CSIC) a través de un contrato del programa Ramón y Cajal (2019) en la Universitat de València.
 
Email
tomas.matus@csic.es
 
 
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RightsPreviewIssue DateTitleAuthor(s)Type
1openAccesscompass.pdf.jpg2022A COMPASS for VESPUCCI: A FAIR way to explore the grapevine transcriptomic landscapeMoretto, Marco; Sonego, Paolo; Pilati, Stefania; Matus, José Tomás CSIC ORCID CVN ; Costantini, Laura; Malacarne, Giulia; Engelen, Kristofartículo
2closedAccessaccesoRestringido.pdf.jpg2017A group of grapevine MYBA transcription factors located in chromosome 14 control anthocyanin synthesis in vegetative organs with different specificities compared with the berry color locusMatus, José Tomás CSIC ORCID CVN ; Cavallini, Erika; Loyola, Rodrigo; Höll, Janine; Finezzo, Laura; Dal Santo, Silvia; Vialet, Sandrine; Commisso, Mauro; Román, Federica; Schubert, Andrea; Alcalde, José Antonio; Bogs, Jochen; Ageorges, Agnès; Battista Tornielli, Giovanni; Arce-Johnson, Patricioartículo
3openAccessasysaccu.pdf.jpg2016A systems-oriented analysis of the grapevine R2R3-MYB transcription factor family uncovers new insights into the regulation of stilbene accumulationWong, Darren C. J.; Schlechter, Rudolf; Vannozzi, Alessandro; Höll, Janine; Hmmam, Ibrahim; Bogs, Jochen; Battista Tornielli, Giovanni; Castellarin, Simone Diego; Matus, José Tomás CSIC ORCID CVN artículo
4openAccessPlants People Planet - 2023 - Cardona‐Medina - Accumulation .pdf.jpg27-Feb-2023Accumulation of azafrin in the root apoplast of the medicinal plant Escobedia grandiflora might play a role in parasitismCardona-Medina, Edison; Santos, Marisa; Nodari, Rubens; Hornero-Méndez, Dámaso CSIC ORCID ; Peris, Arnau; Wong, Darren C. J.; Matus, José Tomás CSIC ORCID CVN ; Rodriguez-Concepcion, Manuel CSIC ORCID artículo
5closedAccess2023Aggregated gene co-expression networks predict transcription factor regulatory landscapes in grapevineOrduña, Luis CSIC ORCID; Santiago, Antonio CSIC ORCID; Navarro-Payá, David CSIC ORCID; Zhang, Chen CSIC ORCID; Wong, Darren C. J.; Matus, José Tomás CSIC ORCID CVN artículo
6openAccessPN40024highly.pdf.jpg2023An improved reference of the grapevine genome reasserts the origin of the PN40024 highly homozygous genotypeVelt, Amandine; Frommer, Bianca; Blanc, Sophie; Holtgräwe, Daniela; Duchêne, Éric; Dumas, Vincent; Grimplet, Jérôme CSIC ORCID; Hugueney, Philippe; Kim, Catherine; Lahaye, Marie; Matus, José Tomás CSIC ORCID CVN ; Navarro-Payá, David CSIC ORCID; Orduña, Luis CSIC ORCID; Tello-Ruiz, Marcela K.; Vitulo, Nicola; Ware, Doreen; Rustenholz, Camilleartículo
7closedAccessaccesoRestringido.pdf.jpgApr-2011Arabidopsis paves the way: Genomic and network analyses in cropsFerrier, Thilia CSIC ORCID; Matus, José Tomás CSIC ORCID CVN ; Jin, Jian; Riechmann, José Luis CSIC ORCIDartículo
8closedAccessaccesoRestringido.pdf.jpg2018Combinatorial regulation of stilbene synthase genes by WRKY and MYB transcription factors in grapevine (Vitis vinifera L.)Vannozzi, Alessandro; Wong, Darren C. J.; Höll, Janine; Hmmam, Ibrahim; Matus, José Tomás CSIC ORCID CVN ; Bogs, Jochen; Ziegler, Tobias; Dry, Ian; Barcaccia, Gianni; Lucchin, Margheritaartículo
9closedAccessaccesoRestringido.pdf.jpg2020Comprehending and improving cannabis specialized metabolism in the systems biology eraRomero, Pablo CSIC; Peris, Arnau; Vergara, K.; Matus, José Tomás CSIC ORCID CVN artículo
10openAccessConstructing Integrated Networks for Identifying.pdf.jpg12-Apr-2017Constructing Integrated Networks for Identifying New Secondary Metabolic Pathway Regulators in Grapevine: Recent Applications and Future OpportunitiesWong, Darren C. J.; Matus, José Tomás CSIC ORCID CVN artículo
11openAccessdevemole.pdf.jpg2015Development of insulin resistance in horses (Equus caballus) etiologic and molecular aspectsGandarillas, Mónica; Matus, José Tomás CSIC ORCID CVN ; Márquez-Hernández, Roberto I.; Vargas-Bello-Pérez, Einarartículo
12openAccessdirecgrape.pdf.jpg2022Direct regulation of shikimate, early phenylpropanoid, and stilbenoid pathways by subgroup 2 R2R3-MYBs in grapevineOrduña, Luis CSIC ORCID; Li, Miaomiao; Navarro-Payá, David CSIC ORCID; Zhang, Chen CSIC ORCID; Ramšak, Živa; Magon, Gabriele; Höll, Janine; Merz, Patrick; Gruden, Kristina; Vannozzi, Alessandro; Cantu, Dario; Bogs, Jochen; Wong, Darren C. J.; Huang, Shao-Shan Carol; Matus, José Tomás CSIC ORCID CVN artículo
13openAccessGB-2014-15-3-R41-S12.PDF.jpg3-Mar-2014Dynamics of chromatin accessibility and gene regulation by MADS-domain transcription factors in flower developmentPajoro, Alice; Madrigal, Pedro; Muiño, Jose M.; Matus, José Tomás CSIC ORCID CVN ; Jin, Jian; Mecchia, Martin A. CSIC ORCID; Debernardi, Juan M.; Palatnik, Javier F.; Balazadeh, Salma; Arif, Muhammad; Ó’Maoiléidigh, Diarmuid S.; Wellmer, Frank; Krajewski, Pawel; Riechmann, José Luis CSIC ORCID; Angenent, Gerco C.; Kaufmann, Kerstinartículo
14closedAccessaccesoRestringido.pdf.jpg2016Genome-wide analyses for dissecting gene regulatory networks in the shoot apical meristemBustamante, Mariana CSIC ORCID; Matus, José Tomás CSIC ORCID CVN ; Riechmann, José Luis CSIC ORCIDartículo
15closedAccessaccesoRestringido.pdf.jpg2023Global analysis of alternative splicing events based on long- and short-read RNA sequencing during grape berry developmentMa, Shuai-Hui; He, Guang-Qi; Navarro-Payá, David CSIC ORCID; Santiago, Antonio CSIC ORCID; Cheng, Yi-Zhe; Jiao, Jia-Bing; Li, Hui-Jie; Zuo, Ding-Ding; Sun, Hao-Ting; Pei, Mao-Song; Yu, Yi-He; Matus, José Tomás CSIC ORCID CVN ; Guo, Da-Longartículo
16openAccessidentifimill.pdf.jpg2021Identification of ABA-mediated genetic and metabolic responses to soil flooding in tomato (Solanum lycopersicum L. Mill)De Ollas, Carlos; González-Guzmán, Miguel CSIC ORCID; Pitarch, Zara; Matus, José Tomás CSIC ORCID CVN ; Candela, Héctor; Rambla, José Luis CSIC ORCID; Granell, Antonio CSIC ORCID; Gómez-Cadenas, Aurelio; Arbona, Vicentartículo
17closedAccessaccesoRestringido.pdf.jpg2014Identification of Arabidopsis knockout lines for genes of interestMatus, José Tomás CSIC ORCID CVN ; Ferrier, Thilia CSIC ORCID; Riechmann, José Luis CSIC ORCIDartículo
18openAccessinspecrespo.pdf.jpg2014Inspection of the grapevine BURP superfamily highlights an expansion of RD22 genes with distinctive expression features in berry development and ABA-mediated stress responsesMatus, José Tomás CSIC ORCID CVN ; Aquea, Felipe; Espinoza, Carmen; Vega, Andrea; Cavallini, Erika; Dal Santo, Silvia; Cañón, Paola; Rodríguez-Hoces de la Guardia, Amparo; Serrano, Jennifer; Battista Tornielli, Giovanni; Arce-Johnson, Patricioartículo
19closedAccessaccesoRestringido.pdf.jpg2021Metabolite analysis reveals distinct spatio-temporal accumulation of anthocyanins in two teinturier variants of cv. ‘Gamay’ grapevines (Vitis vinifera L.)Kong, Junhua; Wu, Jing; Guan, Le; Hilbert, Ghislaine; Delrot, Serge; Fan, Peige; Liang, Zhenchang; Wu, Benhong; Matus, José Tomás CSIC ORCID CVN ; Gomès, Eric; Dai, Zhanwuartículo
20closedAccess5-Aug-2023Multi-Omics Methods Applied to Flower DevelopmentÁlvarez Urdiola, Raquel; Matus, José Tomás CSIC ORCID CVN ; Riechmann, José Luis CSIC ORCIDartículo