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Gómez-Skarmeta, José Luis

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Perfil

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Firma en Digital.CSIC (*)
Gómez-Skarmeta, José Luis
 
Centro o Instituto
CSIC-JA-UPO - Centro Andaluz de Biología del Desarrollo (CABD)
 
Departamento
Regulación génica y morfogénesis. Grupo: Estudios de genómica funcional para comprender el desarrollo, la evolución y las enfermedades genéticas humanas
 
Categoría Profesional
Principal Investigator (In memoriam 2020)
 
Especialización
Combinamos ensayos de epigenómica, experimentos de captura cromosómica, análisis de actividad cis-reguladora mediante transgénesis y estudios mutagénicos para determinar como los elementos cis-reguladores y la estructura de la cromatina contribuyen al desarrollo y a la evolución, y como alteraciones en esta parte no-codificante del genoma afecta a la salud humana.
 
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RightsPreviewIssue DateTitleAuthor(s)Type
1openAccess4Cin_Irastorza_Art_PV.pdf.jpg3-Sep-20184Cin: A computational pipeline for 3D genome modeling and virtual Hi-C analyses from 4C dataIrastorza-Azcárate, Ibai; Acemel, Rafael D.; Tena, Juan J. CSIC ORCID; Maeso, Ignacio; Gómez-Skarmeta, José Luis CSIC ORCID ; Devos, Damien P.artículo
2openAccessCommon_Royo_Art_PV.pdf.jpg8-Mar-2018A common copy-number variant within SIRPB1 correlates with human out-of-Africa migration after genetic drift correctionRoyo, José Luis CSIC ORCID; Valls, Joan; Acemel, Rafael D.; Gómez-Marín, Carlos CSIC ORCID; Pascual-Pons, Mariona; Lupiañez, Arantxa; Gómez-Skarmeta, José Luis CSIC ORCID ; Fibla, J.artículo
3closedAccessaccesoRestringido.pdf.jpg10-Dec-2010A conserved function of the chromatin ATPase Kismet in the regulation of hedgehog expressionTerriente-Félix, Ana CSIC; Molnar, Cristina ORCID; Gómez-Skarmeta, José Luis CSIC ORCID ; Celis, José F. de CSIC ORCIDartículo
4closedAccessaccesoRestringido.pdf.jpg2018A conserved Shh cis-regulatory module highlights a common developmental origin of unpaired and paired finsLetelier, Joaquin; Calle-Mustienes, Elisa de la CSIC ORCID; Pieretti, Joyce; Naranjo, Silvia CSIC ORCID; Maeso, Ignacio; Nakamura, Tetsuya; Pascual-Anaya, Juan; Shubin, Neil H.; Schneider, Igor; Martínez-Morales, Juan Ramón CSIC ORCID; Gómez-Skarmeta, José Luis CSIC ORCID artículo
5openAccessIroquois_genes_2008.pdf.jpg20-Aug-2008A dual requirement for Iroquois genes during Xenopus kidney developmentAlarcón, Pilar CSIC; Rodríguez-Seguel, Elisa CSIC; Fernández-González, Ana CSIC; Rubio, Ruth; Gómez-Skarmeta, José Luis CSIC ORCID artículo
6openAccessmobile insulator.pdf.jpg2014A mobile insulator system to detect and disrupt cis-regulatory landscapes in vertebratesBessa, José CSIC ORCID; Luengo, Mario CSIC; Rivero-Gil, Solangel; Ariza-Cosano, Ana CSIC; Ruiz-Ruano, Francisco J.; Naranjo, Silvia CSIC ORCID; Carvajal, Jaime J. CSIC ORCID; Gómez-Skarmeta, José Luis CSIC ORCID artículo
7closedAccessaccesoRestringido.pdf.jpg2015A novel chromatin insulator regulates the chicken folate receptor gene from the influence of nearby constitutive heterochromatin and the β-globin locusTena, Juan J. CSIC ORCID; Gómez-Skarmeta, José Luis CSIC ORCID ; Recillas-Targa, Félixartículo
8openAccesspolymorphic_enhancer_Lewis.pdf.jpg21-Aug-2014A polymorphic enhancer near GREM1 influences bowel cancer risk through differential CDX2 and TCF7L2 bindingCalle-Mustienes, Elisa de la CSIC ORCID; Giráldez-Pérez, Rosa María; Carvajal, Jaime J. CSIC ORCID; Gómez-Skarmeta, José Luis CSIC ORCID ; Tomlinson, Ianartículo
9openAccessA role for insulator.pdf.jpg2012A role for insulator elements in the regulation of gene expression response to hypoxiaTiana, Maria; Villar, Diego; Pérez-Guijarro, Eva; Gómez-Maldonado, Laura; Moltó, Eduardo; Fernández-Miñán, Ana CSIC ORCID; Gómez-Skarmeta, José Luis CSIC ORCID ; Montoliu, Lluís CSIC ORCID ; Peso, Luis delartículo
10openAccessAcemelRD.pdf.jpg2016A single three-dimensional chromatin compartment in amphioxus indicates a stepwise evolution of vertebrate Hox bimodal regulationAcemel, Rafael D.; Tena, Juan J. CSIC ORCID; Irastorza-Azcárate, Ibai; Marlétaz, Ferdinand; Gómez-Marín, Carlos CSIC ORCID; Calle-Mustienes, Elisa de la CSIC ORCID; Diaz, Sergio G.; Holland, Peter W. H.; Devos, Damien P.; Maeso, Ignacio; Escrivá, Hector; Gómez-Skarmeta, José Luis CSIC ORCID artículo
11openAccessactiveperiod.pdf.jpg2016Active DNA demethylation at enhancers during the vertebrate phylotypic periodBogdanovic, Ozren CSIC ORCID; Calle-Mustienes, Elisa de la CSIC ORCID; Tena, Juan J. CSIC ORCID; Veenstra, Gert Jan C.; Vermeulen, Michiel; Gómez-Skarmeta, José Luis CSIC ORCID ; Lister, Ryanartículo
12openAccessjournal.pgen.1001126.pdf.jpgSep-2010Allelic Variation at the 8q23.3 Colorectal Cancer Risk Locus Functions as a Cis-Acting Regulator of EIF3HNaranjo, Silvia CSIC ORCID; Alonso, M. Eva; Manzanares, Miguel; Gavilán, Angela; Gómez-Skarmeta, José Luis CSIC ORCID ; Houlston, Richard S.artículo
13openAccessAmphioxus_Marlétaz_Art_PV.pdf.jpg6-Dec-2018Amphioxus functional genomics and the origins of vertebrate gene regulationMarlétaz, Ferdinand; Firbas, Panos; Maeso, Ignacio; Tena, Juan J. CSIC ORCID; Bogdanovic, Ozren CSIC ORCID; Perry, M.; Wyatt, Christopher D. R.; Calle-Mustienes, Elisa de la CSIC ORCID; Bertrand, Stephanie; Burguera, Demian; Acemel, Rafael D.; Van Heeringen, Simon J.; Naranjo, Silvia CSIC ORCID; Herrera-Úbeda, Carlos; Skvortsova, Ksenia; Jiménez-Gancedo, Sandra; Aldea, Daniel; Marquez, Yamile; Buono, Lorena CSIC ORCID; Kozmikova, Iryna; Permanyer, Jon; Louis, Alexandra; Albuixech-Crespo, Beatriz; Petillon, Yann Le; Leon, Anthony; Subirana, Lucie; Balwierz, Piotr J.; Duckett, Paul Edward; Farahani, Ensieh; Aury, Jean‐Marc; Mangenot, Sophie; Wincker, Patrick; Albalat, Ricard; Benito-Gutiérrez, Èlia; Cañestro, Cristian; Castro, Filipe; D’Aniello, Salvatore; Ferrier, David E. K.; Huang, Shengfeng; Laudet, Vincent; Marais, Gabriel A. B.; Pontarotti, Pierre; Schubert, Michael; Seitz, Hervé; Somorjai, Ildiko; Takahashi, Tokiharu; Mirabeau, Olivier; Xu, Anlong; Yu, Jr-Kai; Carninci, Piero; Martínez-Morales, Juan Ramón CSIC ORCID; Roest Crollius, Hugues; Kozmik, Zbynek; Weirauch, Matthew T.; Garcia-Fernàndez, Jordi; Lister, Ryan; Lenhard, Boris; Holland, Peter W. H.; Escrivá, Hector; Gómez-Skarmeta, José Luis CSIC ORCID ; Irimia, Manuelartículo
14openAccessS_Campuzano_An_Ancient.pdf.jpg2012An ancient genomic regulatory block conserved across bilaterians and its dismantling in tetrapods by retrogene replacementMaeso, Ignacio; Irimia, Manuel; Tena, Juan J. CSIC ORCID; González-Pérez, Esther CSIC ORCID; Campuzano, Sonsoles CSIC; Gómez-Skarmeta, José Luis CSIC ORCID ; Garcia-Fernàndez, Jordiartículo
15closedAccessaccesoRestringido.pdf.jpg10-May-2011An evolutionarily conserved three-dimensional structure in the vertebrate Irx clusters facilitates enhancer sharing and coregulationTena, Juan J. CSIC ORCID; Alonso, M. Eva; Calle-Mustienes, Elisa de la CSIC ORCID; Splinter, Erik; Laat, Wouter de; Manzanares, Miguel; Gómez-Skarmeta, José Luis CSIC ORCID artículo
16openAccessPreprinpreskarmet.pdf.jpg2018An evolutionary perspective of regulatory landscape dynamics in development and diseaseFranke, Martin; Gómez-Skarmeta, José Luis CSIC ORCID artículo
17openAccesseye morphogenesis.pdf.jpg2015Analysis of opo cis-regulatory landscape uncovers Vsx2 requirement in early eye morphogenesisGago-Rodrigues, Inês CSIC; Fernández-Miñán, Ana CSIC ORCID; Letelier, Joaquin; Naranjo, Silvia CSIC ORCID; Tena, Juan J. CSIC ORCID; Gómez-Skarmeta, José Luis CSIC ORCID ; Martínez-Morales, Juan Ramón CSIC ORCIDartículo
18openAccessAncient_Touceda_PV_Art2020.pdf.jpgOct-2020Ancient Genomic Regulatory Blocks Are a Source for Regulatory Gene Deserts in Vertebrates after Whole-Genome DuplicationsTouceda-Suárez, María; Kita, Elizabeth M.; Acemel, Rafael D.; Firbas, Panos; Magri, Marta Silvia; Naranjo, Silvia CSIC ORCID; Tena, Juan J. CSIC ORCID; Gómez-Skarmeta, José Luis CSIC ORCID ; Maeso, Ignacio; Irimia, Manuelartículo
19openAccessassayATAc.pdf.jpg2020Assaying chromatin accessibility using ATAC-seq in invertebrate chordate embryosMagri, Marta Silvia; Jiménez-Gancedo, Sandra; Bertrand, Stephanie; Madgwick, Alicia; Escrivá, Hector; Lemaire, Patrick; Gómez-Skarmeta, José Luis CSIC ORCID artículo
20openAccessBoundary_Seruggia_Art2020.pdf.jpg2020Boundary sequences flanking the mouse tyrosinase locus ensure faithful pattern of gene expressionSeruggia, Davide; Fernández, Almudena; Cantero, Marta; Fernández-Miñán, Ana CSIC ORCID; Gómez-Skarmeta, José Luis CSIC ORCID ; Pelczar, Pawel; Montoliu, Lluís CSIC ORCID artículo