аЯрЁБс > ўџ 3 5 ўџџџ 2 џџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџьЅС #` №П Љ bjbj5G5G . W- W- Љ џџ џџ џџ Є Ќ Ќ Ќ Ќ Ќ Ќ Ќ Р Р F @ 8 8 8 8 8 Х Ч Ч Ч Ч Ч Ч $ h ю ы Ќ Y Y Y ы Ќ Ќ 8 8 л Ѕ Ѕ Ѕ Y Ќ 8 Ќ 8 Х Ѕ Y Х Ѕ Ѕ Ќ Ќ Ѕ 8 , аvЕеЧ o Ѕ Х 0 F Ѕ Ѕ Ќ Ѕ 0 C " Ѕ e и ы ы F Y Y Y Y Р Р Р D Р Р Р Р Р Р Ќ Ќ Ќ Ќ Ќ Ќ џџџџ Additional file 2 File format: PDF Title: Mulan multiple alignment of NOS-2 promoters (proximal region) Description: Presence of (A)n simple repeat only present in primates; the repeat is also present in chimp (data not shown). A. Repeats masked: Dog CACAGAGTGATGTAACAACAAGGTCAGGTCACCCATAGGCCAGGAGCCCCAGGCCAGAAG Mouse CACAGAGTGATGTAATCA-----------AGCACACAGA--------------CTAGGAG Rat CACAGAGTGACGTAATAA-----------TGCATACAGA--------------CTAGGAG Human CACAGAGTGATGTAACAGCAAGATCAGGTCACCCACAGGCC------------CTGGCAG -151 ********** **** * * ** * * ** (B site Dog TCCCAGTCATAAATTAGCAAAC-TGTACACCCAGCCCGGGACACTCCCTTTGGAAA---- Mouse TGTCCATCATGAATGAGCTAACTTGCACACCCAACTGGGGACTCTCCCTTTGGGAA---- Rat TGTCCATCGCGAATGAGCTAACTTGCACACCCTACTGGGGACTCTCCCTTTGGGAA---- Human TCACAGTCATAAATTAGCTAAC-TGTACA-CAAGCTGGGGACACTCCCTTTGGAAACCNN -93 * * ** *** *** *** ** *** * * ***** ********** ** Dog ----------AATAAAAAGAGACCTTTATGCAAAAACGGCTCCCTGGAATGATGTGGGGT Mouse ----------------CAGT------TATGC-AAAATAGCTCTGCAG---AGCCTGGAG- Rat ----------------CAGTGA-CTTTATGC-AAAACAGCTCTGCAG---AGCGTGGAT- Human NNNNNNNNNNNNNNNNNNGAGACCTTTATGCAAAAACAACTCTCTGG-ATGGCATGGGGT -34 * ***** **** *** * *** B. No masked sequences: Rat AA-----------TGCATACAGA--------------CTAGGAGTGTCCATCGCGAATGA Dog AACAAGGTCAGGTCACCCATAGGCCAGGAGCCCCAGGCCAGAAGTCCCAGTCATAAATTA Mouse CA-----------AGCACACAGA--------------CTAGGAGTGTCCATCATGAATGA Human AGCAAGATCAGGTCACCCACAGGCC------------CTGGCAGTCACAGTCATAAATTA -135 * * ** * * *** * ** *** * (B site Rat GCTAACTTGCACACCCTACTGGGGACTCTCCCTTTGG--------------------GAA Dog GCAAAC-TGTACACCCAGCCCGGGACACTCCCTTTGG--------------AAAAATAAA Mouse GCTAACTTGCACACCCAACTGGGGACTCTCCCTTTGG--------------------GAA Human GCTAAC-TGTACA-CAAGCTGGGGACACTCCCTTTGGAAACCAAAAAAAAAAAAAAAAAA -77 ** *** ** *** * * ***** ********** ** Rat CAGTGA-CTTTATGC-AAAACAGCTCTGCAG---AGCGTGGAT-GGGTATAAATACCTG- Dog AAGAGACCTTTATGCAAAAACGGCTCCCTGGAATGATGTGGGGTGGGTATAAATACCTCT Mouse CAGT------TATGC-AAAATAGCTCTGCAG---AGCCTGGAG-GGGTATAAATACCTG- Human AAGAGACCTTTATGCAAAAACAACTCTCTGG-ATGGCATGGGGTGAGTATAAATACTTC- -19 ** ***** **** *** * *** * ********** * * g Ќ Џ у ф х ч ш ћ К Л ї D I J N о ш ызызызыФФ{kXkGkGkGkGkGkG !*h-j[ CJ OJ QJ ^J mH sH $ j k№h-j[ CJ OJ QJ ^J mH sH h-j[ CJ OJ QJ ^J mH sH $h-j[ 5CJ OJ QJ \^J mH sH h-j[ OJ QJ ^J mH sH hW` h-j[ OJ QJ ^J mH sH ,hW` h-j[ CJ OJ PJ QJ ^J aJ mH sH $hW` h-j[ CJ OJ QJ ^J mH sH 'hW` h-j[ CJ OJ QJ \^J mH sH 'hW` hW` CJ OJ QJ \^J mH sH # h х ц ч ш ћ ќ § J ф 6 Т \ Љ њ G H т / Э Ю § § § § § § § ѕ ѕ ѕ ѕ ѕ ѕ ѕ ѕ ѕ ѕ ѕ ѕ ѕ ѕ ѕ ѕ ѕ ѕ ѕ ѕ ѕ $dh a$ Љ § ш ѓ ѕ ? Q а щ Т Ь \ a b f Љ Г О а Ј Љ №п№п№Ь№Й№Ј№Ј№Ј№Ј№Ј№Ј№п№п№ h-j[ OJ QJ ^J mH sH !*h-j[ CJ OJ QJ ^J mH sH $ j k№h-j[ CJ OJ QJ ^J mH sH $h-j[ 5CJ OJ QJ \^J mH sH !*h-j[ CJ OJ QJ ^J mH sH h-j[ CJ OJ QJ ^J mH sH Ю Я а ш щ 6 а " o ъ 7 е " # p Н [ Ј Љ ї ї ї ї ї ї ї ї ї ї ї ї ї ї ї ї ї ї ї ї ї ѕ $dh a$ , 1hА. АЦA!АЅ"АЅ#$%А АФАФФ @ @ёџ @ N o r m a l CJ _HaJ mH sH tH \ @ " \ T э t u l o 2 Єd Єd @&[$\$ 5CJ$ OJ PJ QJ \^J aJ$ N A ђџЁ N F u e n t e d e p с r r a f o p r e d e t e r . V i@ѓџГ V T a b l a n o r m a l :V і 4ж 4ж l aі , k@єџС , S i n l i s t a e@ ђ H T M L c o n f o r m a t o p r e v i o 7 Ц2 (М Pфx 4 Ш#\'№*.2Ќ5@9 CJ OJ PJ QJ ^J aJ Љ џџџџ # h х ц ч ш ћ ќ § J ф 6 Т \ Љ њ G H т / Э Ю Я а ш щ 6 а " o ъ 7 е " # p Н [ Ј Ћ 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 ш Љ Ю Љ Љ №8 № @ ё џџ џ ї № № №0 №( № № №B № S № П Ы џ ? № џџ tI 1 ьћ Ћ Ћ 8 *urn:schemas-microsoft-com:office:smarttagsCity 9 *urn:schemas-microsoft-com:office:smarttagsState 9 *urn:schemas-microsoft-com:office:smarttagsplace FP * / Ћ Ћ 3 l Ј Ћ Ћ х -j[ W` џ@ L