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Title

TrwB: Un motor molecular de unión específica a estructuras G-quádruplex en el ADN

AuthorsMatilla, Inmaculada
AdvisorCabezon, Elena
Issue Date4-Nov-2011
PublisherUniversidad de Cantabria
AbstractLa transferencia de ADN por conjugación es un mecanismo de transferencia horizontal que permite la adquisición de nueva información genética de un modo rápido y natural. Este proceso implica un contacto físico entre las células donadora y receptora. Los sistemas conjugativos contienen una proteína clave en la membrana plasmática para llevar a cabo esta función: el transportador de ADN. En nuestro sistema modelo, el plásmido R388, este transportador es la proteína TrwB. La estructura cristalográfica de TrwB¿N70, la fracción soluble de TrwB, revela un hexámero formado por subunidades idénticas y simetría toroidal, con un canal interno de 20 Å de diámetro (Gomis-Ruth et al., 2001). Esta proteína presenta una gran similitud estructural con motores moleculares hexaméricos bien conocidos, tales como el complejo F1-ATPasa (Abrahams et al., 1994), FtsK (Massey et al., 2006) o helicasas en forma de anillo (Singleton et al., 2000), sugiriendo que TrwB también funciona como un motor, utilizando la energía liberada en la hidrólisis de ATP para bombear ADN de cadena sencilla a través de su canal central. En helicasas hexámericas que funcionan en dirección 5'- 3', el extremo 5' pasa a través del canal central de la proteína (Yu et al., 1996) mientras que el extremo 3' contacta la zona externa del hexámero (Ahnert and Patel, 1997). Así pues, de una manera similar, el T-DNA conjugativo sería transferido en dirección 5'-3' a través de la cavidad interna de TrwB. El mecanismo que proponemos para TrwB es similar al que presenta el complejo F1-ATPasa. La hidrólisis secuencial de ATP estaría acoplada a la translocación del ADN a través del poro central, siguiendo un mecanismo similar al >binding change mechanism> seguido por el complejo F1-ATPasa (Abrahams et al., 1994; Boyer, 1993). Sucesivos ciclos de hidrólisis de ATP permitirían cambios conformacionales alternantes en las seis subunidades. Proponemos por lo tanto un mecanismo común que podría aplicarse a una gran variedad de enzimas con un componente estructural común (Cabezon and de la Cruz, 2006).
URIhttp://hdl.handle.net/10261/88738
Appears in Collections:(IBBTEC) Tesis
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