Descripción de un proceso de transcripción antisentido masivo que dirige el procesamiento del mRNA en bacterias

Abstract

Las nuevas tecnologías de secuenciación masiva de RNA están poniendo de manifiesto que los transcriptomas bacterianos además de mRNA, rRNA y tRNA, contienen una gran cantidad de RNAs no codificantes, RNAs antisentido, largas regiones no traducidas 5' y 3', y operones alternativos. En muchos casos estos RNA son solapantes debido a que se producen desde cadenas complementarias de una misma región del DNA. En este estudio, gracias a la aplicación de secuenciación masiva de RNA sobre fracciones largas y cortas (>50 nucleótidos) de RNA obtenidas del patógeno humano Staphylococcus aureus, hemos detectado la presencia a lo largo del genoma de una colección de RNAs cortos. Esta colección se genera por la digestión de transcritos sentido/antisentido solapantes por la enzima RNasa III. Este proceso afecta al menos al 75% de los RNA sentido de los genes anotados. La eliminación de la actividad RNasa III inhibe la producción de los RNAs cortos y viene acompañada de la acumulación de los transcritos solapantes. Estos resultados indican que la existencia de un proceso de transcripción antisentido generalizada a la vez que discreta permite a la bacteria procesar los transcritos sentido mediante la formación de sustatos de doble cadena. Este proceso de digestión de trascritos solapantes mediado por RNasa III está presente en diferentes bacterias Gram-positivas y puede proporcionar un mecanismo posttranscripcional de regulación de los niveles de mRNA que actúa de forma global.