El Centro de Ciencias Medioambientales ha sufrido numerosos cambios a lo largo de sus 60 años de historia, tanto en sus líneas de investigación como en su plantilla investigadora y administrativa. Estos cambios, combinados con los que han tenido lugar en los Planes Nacionales de Investigación y en los Planes Estratégicos del CSIC, han dado lugar a una serie de reestructuraciones para adecuar el Centro a esta realidad cambiante.
Desde el día 25 de enero de 2011 el Centro de Ciencias Medioambientales, que estaba formado por el Instituto de Ciencias Agrarias (ICA) y el Instituto de Recursos Naturales (IRN), pasó a ser el Instituto de Ciencias Agrarias (ICA). Los investigadores del IRN se integraron en el Museo Nacional de Ciencias Naturales (MNCN) y en el propio ICA.
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