La conformación de glicomiméticos en su estado libre en disolución y asociados a sus receptores. Una visión 3D utilizando RMN

Abstract

Relacionado con su menor capacidad inmuno estimulante. Los resultados obtenidos del estudio conformacional y su interacción con el anticuerpo correspondiente del C-PSC de MenA nos indican que estamos ante una molécula muy flexible en disolución, no pudiéndose determinar en este caso una selección conformacional del trisacarido por parte del anticuerpo en el complejo. Por último se han realizado estudios de interacción entre las cadenas N-glicánicas de glicoproteínas y la heveína. Para ello se ha utilizado como ligando modelo el glicopeptido manosil quitobiosa asparragina. En un primer pasa se ha realizado el estudio conformacional del ligando libre tras el cual ha pasado al estudio del complejo carbohidrato proteina. El estudio de la interacción se monitorizó mediante una valoración seguida mediante RMN que permitió obtener la constante de asociación y los valores termodinámicos del proceso. Mediante la aplicación de metodología y aplicaciones de métodos modernos de modelización molecular de oligosacáridos y compuestos relacionados se abordó el estudio de la estructura tridimensional del complejo, concretamente cálculos de "docking" y de dinámica molecular solvatada utilizando para ello los programas de cálculo Autodock 3.05 y AMBER 8. Los resultados obtenidos de esta modelización han sido confirmados, de momento de forma cualitativa, mediante la observación de picos de cruce intermoleculares clave en el esprectro NOESY del complejo.