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Title

Method for identifying peptides and proteins according to mass spectrometry data

Other TitlesMétodo de identificación de péptido y proteínas a partir de datos de espectrometría de masas
AuthorsAlbar, Juan Pablo; Ramos Fernández, Antonio
Issue Date6-Jan-2011
CitationWO2011000991 A1
Abstract[ES] La presente invención se refiere a un método de identificación de péptidos y proteinas a partir de datos de espectrometría de masas empleando múltiples motores de búsqueda, caracterizado porque: a) se modelizan las puntuaciones calculadas en cada motor; b) se incluye la presencia de parámetros de concordancia; c) se modeliza la distribución de metapuntuaciones mediante funciones de distribución; d) se construyen las puntuaciones del péptido y de la proteina precursora. Entre las principales ventajas que presenta la invención, cabe citar su flexibilidad para ser aplicada a un número arbitrario de motores, el empleo de parámetros de concordancia que agregan de información adicional no disponible con un solo motor, el aumento del número de péptidos- proteínas identificados o su versatilidad para incorporar otras fuentes de información adicionales, en función del tipo de experimento analizado.
[EN] The present invention relates to a method for identifYing peptides and proteins according to mass spectrometry data using a plurality of search engines, characterised in that said method includes: a) modelling the scores calculated in each engine; b) including the presence of concordance parameters; c) modelling the distribution of meta-scores using distribution functions; d) building the scores of the peptide and the precursor protein. The main advantages of the invention include the flexibility thereof for being applied to an arbitrary number of engines, the use of concordance parameters that aggregate additional information not available with a single engine, the increased number of peptides and proteins identified or the versatility of the invention for including other additional sources of information, according to the type of experiment analysed.
URIhttp://hdl.handle.net/10261/41561
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