Estudio comparativo de expresión génica en el vestíbulo del ratón deficiente en Igf1 mediante arrays

Abstract

El oído interno está formado por los órganos auditivo y vestibular, que comparten un origen embrionario común. La deficiencia en el factor de crecimiento similar a insulina tipo 1 (IGF-1) causa hipoacusia neurosensorial en el hombre y en el ratón. Estudios previos han mostrado que el IGF-1 modula la neurogénesis del ganglio cocleovestibular en el embrión de pollo. Estudiamos aquí el papel del IGF-1 en la estructura y función del vestíbulo utilizando el ratón deficiente en Igf1. A las edades estudiadas, E18.5, P15 y P90, la comparación del ratón silvestre con el deficiente en Igf1, indicó que no hay diferencias en la función vestibular, ni en la morfología general del vestíbulo. Sin embargo, sí se observó a las edades postnatales una expresión génica diferenciada. Se compararon los transcriptomas mediante arrays de amplia cobertura (Affymetrix® Mouse Gene 1.1 ST Array). Los resultados se analizaron en primer lugar mediante Limma y maSigPro y posteriormente con RMA-VSN y mmBGX para detección de falsos positivos y estimación de la incertidumbre. La validación de los resultados se realizó mediante RT-qPCR de genes concretos y miRNAs seleccionados por su expresión diferencial en el vestíbulo a distintas edades, por su relación con sordera, con el sistema del IGF o por su expresión en el oído interno. Finalmente, se realizó el análisis funcional in silico de los genes expresados diferencialmente para definir las posibles vías de señalización implicadas en el desarrollo del vestíbulo o que se ven afectadas por la deficiencia de IGF-I.