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20-Oct-2008Assessment of protein set coherence using functional annotationsChagoyen, Mónica; Carazo, José M.; Pascual-Montano, AlbertoArtículo
17-Feb-2006Biclustering of gene expression data by non-smooth non-negative matrix factorizationCarmona-Sáez, Pedro; Pascual-Marqui, Roberto D.; Tirado, Francisco; Carazo, José M.; Pascual-Montano, AlbertoArtículo
28-Jul-2006bioNMF: a versatile tool for non-negative matrix factorization in biologyPascual-Montano, Alberto; Carmona-Sáez, Pedro; Chagoyen, Mónica; Tirado, Francisco; Carazo, José M.; Pascual-Marqui, Roberto D.Artículo
1-Jul-2008bioNMF: a web-based tool for nonnegative matrix factorization in biologyMejía-Roa, Edgardo; Carmona-Sáez, Pedro; Nogales-Cadenas, Rubén; Vicente, C.; Vázquez Valero, Manuela; Yang, X. Y.; García, C.; Tirado, Francisco; Pascual-Montano, AlbertoArtículo
29-Oct-2008CentrosomeDB: a human centrosomal proteins databaseNogales-Cadenas, Rubén; Abascal, Federico; Díez-Pérez, Javier; Carazo, José M.; Pascual-Montano, AlbertoArtículo
12-Mar-2008ChIPCodis: Mining complex regulatory systems in yeast by concurrent enrichment analysis of Chip-on-chip dataAbascal, Federico; Carmona-Sáez, Pedro; Carazo, José M.; Pascual-Montano, AlbertoArtículo
1-Jul-2013Chromothripsis: Breakage-fusion-bridge over and over againSánchez Sorzano, Carlos Oscar; Pascual-Montano, Alberto; Sánchez de Diego, Ainhoa; Martínez-A, Carlos; Van Wely, Karel H. M.Artículo
26-Jan-2006Discovering semantic features in the literature: a foundation for building functional associationsChagoyen, Mónica; Carmona-Sáez, Pedro; Shatkay, Hagit; Carazo, José M.; Pascual-Montano, AlbertoArtículo
2011Functional analysis beyond enrichment: Non-redundant reciprocal linkage of genes and biological termsFontanillo, Celia; Nogales-Cadenas, Rubén; Pascual-Montano, Alberto; De Las Rivas, JavierArtículo
4-Jan-2007GENECODIS: a web-based tool for finding significant concurrent annotations in gene listsCarmona-Sáez, Pedro; Chagoyen, Mónica; Tirado, Francisco; Carazo, José M.; Pascual-Montano, AlbertoArtículo
7-Feb-2006Integrated analysis of gene expression by association rules discoveryCarmona-Sáez, Pedro; Chagoyen, Mónica; Rodríguez, Andrés; Trelles, Oswaldo; Carazo, José M.; Pascual-Montano, AlbertoArtículo
26-Jul-2006A literature-based similarity metric for biological processesChagoyen, Mónica; Carmona-Sáez, Pedro; Gil, Concha; Carazo, José M.; Pascual-Montano, AlbertoArtículo
26-Mar-2010Moara: a Java library for extracting and normalizing gene and protein mentionsNeves, Mariana L.; Carazo, José M.; Pascual-Montano, AlbertoArtículo
20-Jun-2002Non-linear data mapping and dimensionality reduction systemPascual-Marqui, Roberto D.; Pascual-Montano, Alberto; Kochi, Kieko; Carazo, José M.Patente
22-Aug-2007Non-linear data mapping and dimensionality reduction systemPascual-Marqui, Roberto D.; Pascual-Montano, Alberto; Kochi, Kieko; Carazo, José M.Artículo
2011Predicción bioinformática y validación experimental de nuevos aisladores genómicosVicente-García, Cristina; Moltó, Eduardo; Tena, Juan J.; Fernández-Miñán, Ana; Jiménez, Natalia; Barrios, Laura; Pascual-Montano, Alberto; Carazo, José M.; Gómez-Skarmeta, José Luis; Montoliu, LluísComunicación de congreso
29-Feb-2008SPACE: an algorithm to predict and quantify alternatively spliced isoforms using microarraysAntón, Miguel A.; Gorostiaga, Dorleta; Guruceaga, Elizabeth; Segura, Víctor; Carmona-Sáez, Pedro; Pascual-Montano, Alberto; Pio, Rubén; Montuenga, Luis M.; Rubio, AngelArtículo
2013Surfing transcriptomic landscapes. A step beyond the annotation of chromosome 16 proteomeMedina-Aunon, J. Alberto; Martínez-Bartolomé, Salvador; Abián, Joaquín; Carrascal, Montserrat; Casal Álvarez, José Ignacio; Dasilva, Noelia; Díez, Paula; Fuentes, Manuel; Gallardo, Oscar; Gharbi, Severine; González-Tejedo, C.; Lombardía, Manuel; López-Lucendo, María F.; Marcilla, Miguel; Mendes, Marta; Pascual-Montano, Alberto; Tabas-Madrid, Daniel; Villanueva, Joan; Albar, Juan Pablo; Corrales, Fernando J.Artículo
18-Dec-2011U-Compare bio-event meta-service: compatible BioNLP event extraction servicesKano, Yoshinobu; Bjorne, Jari; Ginter, Filip; Salakoski, Tapio; Buyko, Ekaterina; Hahn, Udo; Cohen, K BRETONNEL; Verspoor, Karin; Roeder, Christophe; Hunter, Lawrence E; Kilicoglu, Halil; Bergler, Sabine; Landeghem, Sofie VAN; Parys, Thomas VAN; Peer, Yves VAN DE; Miwa, Makoto; Ananiadou, Sophia; Neves, Mariana L.; Pascual-Montano, Alberto; Ozgur, Arzucan; Radev, Dragomir R; Riedel, Sebastian; Saetre, Rune; Chun, Hong-Woo; Kim, Jin-Dong; Pyysalo, Sampo; Ohta, Tomoko; Tsujii, Jun'ichiArtículo
14-Aug-2004XMIPP: a new generation of an open-source image processing package for electron microscopySánchez Sorzano, Carlos Óscar; Marabini, Roberto; Velázquez-Muriel, Javier; Bilbao-Castro, José Román; Scheres, Sjors H. W.; Carazo, José M.; Pascual-Montano, AlbertoArtículo

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